荧光标记是将荧光基团共价连接到蛋白、核酸等分子上的过程。通过了荧光染料上的特定基团，与需要识别的分子物质上的特定基团反应，从而完成其标记过程，利用标记物的荧光特性，来提供被检测对象的信号。荧光标记物种类多、标记方法灵活，可应用于多种生物大分子以及药物的检测。

其中常用的荧光染料之一的花菁染料，也叫CY(Cyanine)染料是一种常见的荧光化合物，也是一种多甲川染料的衍生物。它是由两个氮原子为杂环核组成的，且具有荧光稳定、多聚次甲基桥链化学结构、摩尔吸收系数大和荧光量子产率高等优点。用于标记生物分子例如DNA和蛋白质，比较常见的花菁染料有CY3、CY5、CY7和Sulfo-CY3、sulfo-CY5、sulfo-CY7

另一种常用的是异硫氰酸荧光素(FITC)标记，异硫氰酸荧光素(FITC)具有永久性标记生物分子的独特检测性能，可用于检测或跟踪共轭物与其他生物分子的相互作用。FITC的异硫氰酸酯能与蛋白质或抗体的伯胺基发生反应，带有NH2基团的小分子药物均可用FITC进行荧光标记。异硫氰酸荧光素(FITC)吸收和发射波长分别是495nm和520nm。

相关材料案例有：

卵清蛋白-cy7

Plga-cy5/cy5.5/cy3/FITC/RB

DSPE-PEG-CY3

DSPE-PEG-CY5

DSPE-PEG-CY5.5

DSPE-PEG-FITC

DSPE-PEG-RB

DHA-CY5

DPA-CY3

cy7-PEG2000-SH

APC-cy7-peg2000-biotin

CY5标记槲皮素-铁

SH-PEG2000-Cy7

CLS-PEG2000-FITC 胆固醇聚乙二醇FITC

FITC-PEG2000-NH2

3-氨丙基三乙氧基硅烷-FITC

HA700K分子量-FITC

FITC-Glucose 荧光素标记葡萄糖

FITC-Lactoferrin;荧光素标记乳铁蛋白

FITC-二硫键-FITC

葡聚糖4000-fitc

PLL-FITC 荧光素标记聚赖氨酸

FITC标记反油酸