藻红蛋白(Phycoerythrin,PE)是藻胆蛋白的一种，是从红藻中分离纯化的一种荧光藻胆蛋白，与FITC等荧光素一样是使用地新型荧光标记试剂。

藻红蛋白是较强的橙色荧光藻胆蛋白，荧光比其他传统的有机荧光明亮、稳定。其荧光强度是普通荧光素的30-100倍。具有很好的吸光性能和量子产率，在可见光谱区有很宽的激发及发射范围。

结构：分子结构为通过硫醚键连接的载体蛋白与开链线性延展的四咯化合物。

藻红蛋白具有性质稳定、荧光量子产率高、背景干扰小、易于同生物素、抗体和糖蛋白等大分子交联等特点。藻红蛋白其荧光强度是普通荧光素的30-100倍。具有很好的吸光性能和很高的量子产率，在可见光谱区有很宽的激发及发射范围。

藻红蛋白的应用

1.藻红蛋白可以将其与生物素、亲和素和各种单克隆抗体结合；

2.藻红蛋白用于荧光显微检测、荧光免疫测定、双色或多色荧光分析、流式细胞荧光测定等抗体荧光标记；

3.藻红蛋白可以应用于活体成像等生物工程技术。