羧基化cy5-COOH荧光修饰1032678-07-1用于多种生物学的花菁染料

花青素用于多种生物学应用，包括比较基因组杂交和基因芯片等。 根据结构，它们覆盖可见光谱和红外波长。Cy3，Cy5和Cy7是流行的花青染料，特别是Cy3和Cy5通常用于2种颜色检测。Cy3染料发黄绿色荧光(ex / em = ~550 / 570)，而Cy5在红色区域发荧光(ex / em = ~650 / 670nm)。这种非磺化花青不溶于水，主要用于标记寡核苷酸，肽和其他小分子。

Cy系列荧光染料包含两种异构体的形式，一种是非磺化花青素(non-sulfonated cyanines)，一种是磺化花青素(sulfonated cyanine)。

非磺化Cy染料的水溶性通常比较低。在标记生物分子时，常常需要加入有机溶液(一般是DMF或DMSO)。常规操作是将染料先溶于有机溶剂中，然后按比例加入到生物分子的水溶液中反应。反应完成后离心除去沉淀的染料，再透析除去未反应的染料小分子。非磺化Cy染料易溶于氯仿，甲醇，THF，乙腈等常规有机溶剂，适用于有机合成反应。因此，非磺化Cy染料可以直接在有机溶剂中与有机小分子反应，标记小分子或者高分子材料。

磺化Cy染料在其发色团上各有两个硫酸离子官能团，所以这类染料具有非常好的水溶性。在对样品水溶性要求较高时，磺化Cy染料是更好的选择。磺化后，Cy染料的荧光谱图发生了非常小的蓝移，这是一个非常普遍的现象，蓝移后激发峰和发射峰仍在仪器的检测范围之内，所以不必更改仪器参数。

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