远红外（620-660nm处激发）
1.CF 620R、LightCycler Red 640等620nm
CF ™ 620R是以红色荧光染料罗丹明为基础的远红外的荧光染料，该染料有较高荧光亮度和极度的耐光性。它的吸收和发射光谱为617 和639nm，该染料能被用于荧光能量共振转移中高能量的接收者，或者在激发和发射窗口能和该染料的光谱特性匹配的条件下，被应用于多色检测中的荧光量采集。

2.CF 633、Alexa Fluor 633等633/635nm 激光线的染料荧光染料
（1）CF 633染料的优点：当被633 nm 氦氖激光或635 nm 红色二极管激光激发时，产生抗体耦联物；光稳定性高于AlexaFluor 647；

（2）CF 640、Alexa Fluor 647, ATTO 647N, Cy5, DyLight649等远红外荧光染料；

（3）CF640R的优点：以红色染料罗丹明为基础，吸收和发射峰类似Cy5、Alexa Fluor647；但以罗丹明为基础的红色染料CF 640R它的优点就是对光稳定性，Cy5 和 Alexa Fluor 647以花青素为基础，因此有着和花青素一样的特点即耐光性较差；

（4）CF 647、Alexa Fluor 647, ATTO 647N, DyLight649等远红外荧光染料；以花青素为基础的远红外荧光染料CF 647 比Cy 5、Alexa Fluor 647 明亮。

（5）CF 660、Alexa Fluor® 660, Allophycocyanin (APC)等介于远红外近红外之间的荧光染料。

近红外（680-790nm处激发）
1.CF 680R/ 680、Alexa Fluor 680, Cy 5.5,IR Dye 680等近红外荧光染料，CF680是高水溶性的以花青素为基础的染料，分子量大约为3000。该染料常用来标记抗体，发出荧光和在免疫染色光谱相似的染料中产生信噪比；

2.CF 680R 分子量约为900，更适合标记核酸或者相对小的生物分子。CF680R 以罗丹明为基础的高荧光亮度, 耐光性染料，被用于共聚焦显微镜。

3.CF 750、CF™770 and CF™790等近红外荧光染料，CF750、CF770、CF790是领域内真正具有突破性的长波长的新型染料代表。其他近红外染由于受到染料聚集和稳定性差等因素的影响而导致荧光亮度有限。即使在633 nm 被激发，CF750也会比APC-AlexaFluor 750拥有足够的亮度来在流式细胞仪检测中带来更好的信噪比。