1、免疫原性与抗原性消除或降低

消除或降低蛋白质等高分子的抗原性效果。聚乙二醇为一种亲水不带电荷的线性大分子当它与蛋白质的非必需基团共价结合时,可作为一种屏障挡住蛋白质分子表面的抗原决定簇,避免抗体的产生或者阻止抗原与抗体的结合而抑制免疫反应的发生。

2、热稳定性提高

这是由于聚乙二醇共价连接蛋白质等高分子后，其天然构象产生一定的刚性，不易伸展失活，减少了分子内部基团的热振动，从而增加了热稳定性。热稳定性与聚乙二醇和蛋白质等高分子之问的交联点数目有关，单点交联并不明显，交联点增多稳定性提高。热稳定性提高的另外一个原因是聚乙二醇本身增加了蛋白质等高分子的表面亲水性，使其在水溶液中形成新的氢键和盐桥。

3、抗各类失活因子能力提高

聚乙二醇修饰后的蛋白质等高分子抗蛋白水解酶水解、抗抑制剂、抗酸碱和有机溶剂等变性失活能力提高。原因是聚乙二醇所产生的空间屏蔽阻挡了失活因子的进攻。此外，蛋白质等高分子中对蛋白水解酶等失活因子敏感基团被修饰，使其能力提高。

4、体内半衰期延长

许多蛋白质等高分子经聚乙二醇修饰后，抗蛋白水解酶、抗抑制剂等失活因子的能力和热稳定性提高。

5、溶解性增加

聚乙二醇易溶于水和多数极性溶剂，不溶于脂肪经类、苯和矿物油等非极性溶剂。随相对分子质量升高，其在极性溶剂中的溶解度逐渐下降。

6、对组织分布能力的改变

一些蛋白质等高分子经聚乙二醇修饰后可改变组织的分布能力，能在血液中被靶器官选择性吸收。